RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPAG6O75602 509 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOMM70O94826 608 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APRTP07741 180 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC10A3P09131 477 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOT1P17174 413 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT4P19013 534 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCTRP47872 440 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXW10Q5XX13 1052 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNT2Q6UVM3 1135 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf22Q6V702 233 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA21Q7Z572 469 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NT5C3BQ969T7 300 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SENP8Q96LD8 212 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC4Q9HBW1 653 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTLQ9NZJ0 730 aa19.4■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSC2P49815 1807 aa19.39■□□□□ 0.7
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCATO75600 419 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUN1O94901 812 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGK1P00558 417 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNA1P02708 482 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THP07101 528 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMPD1P23109 780 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOS2P35228 1153 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL4AP40617 200 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFV1P49821 464 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CGB2Q6NT52 195 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BNIPLQ7Z465 357 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HACE1Q8IYU2 909 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPPQ93052 612 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPY6RQ99463 290 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED10Q9BTT4 135 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRTAC1Q9NQ79 661 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT82Q9NSB4 513 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRID1Q9ULK0 1009 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLCNKBP51801 687 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTFR1Q15390 333 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC1A5Q15758 541 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS52Q8N1B4 723 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC33Q8N5R6 958 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST12Q9NRB3 414 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa19.39■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL18O95568 372 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM200BP0CF97 657 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K7CLP57077 242 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERINC5Q86VE9 423 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C3orf58Q8NDZ4 430 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCUQ8NE86 351 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIB2Q92519 343 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLFM3Q96PB7 478 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCF3Q9NUQ8 709 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIOSQ9NXC5 875 aa19.38■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LHX1P48742 406 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TKTL1P51854 596 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS9BPQ6ZS82 235 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM86AQ8N2M4 240 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC44A1Q8WWI5 657 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP36Q96G28 342 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC2A13Q96QE2 648 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT15Q9BQS2 421 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POPDC2Q9HBU9 364 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNPLA8Q9NP80 782 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF4Q9NR80 690 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL5CA6NH57 179 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0QYT0 321 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZWINTO95229 277 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDK4Q16654 411 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HFE2Q6ZVN8 426 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITPNM3Q9BZ71 974 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX16Q9P0S2 106 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGKIO75912 1065 aa19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QAP02745 245 aa19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEA3P43357 314 aa19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCNN1GP51170 649 aa19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGAT3Q09327 533 aa19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTK7Q13308 1070 aa19.36■□□□□ 0.69
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD14CQ5VZR4 134 aa19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms