RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CXCL12P48061 93 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 KDSRQ06136 332 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 MESP2Q0VG99 397 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PNKPQ96T60 521 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 IER2Q9BTL4 223 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 BBS2Q9BXC9 721 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CBX8Q9HC52 389 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 R4GN57 208 aa26.12■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SART1O43290 800 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CCR3P51677 355 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SEC13P55735 322 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SFTPA1Q8IWL2 248 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PLD4Q96BZ4 506 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 NOX5Q96PH1 765 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SPAG5Q96R06 1193 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ERGIC2Q96RQ1 377 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP83Q9Y592 693 aa26.11■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ANTXRLA6NF34 631 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX5P35711 763 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF5Q15542 800 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 MSANTD2Q6P1R3 559 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 MAMSTRQ6ZN01 415 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNCQ9H7C4 482 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF4Q9NR80 690 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PLK2Q9NYY3 685 aa26.1■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 K7EQS6 105 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 CAPN9O14815 690 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TULP3O75386 442 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 APODP05090 189 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TYRP14679 529 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXC13P31276 330 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 HARS2P49590 506 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 JAM2P57087 298 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO43Q4G163 708 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SYPL2Q5VXT5 272 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 LUZP1Q86V48 1076 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM35BQ8NCS4 154 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAM32Q8TC27 787 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 DEC1Q9P2X7 70 aa26.09■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM24O15164 1050 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 KAT7O95251 611 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ERBB2P04626 1255 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 MMEP08473 750 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 STAT1P42224 750 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 C2orf27AQ580R0 203 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC20A1Q8WUM9 679 aa26.08■■□□□ 1.77
HTATSF1-202ENST00000425695 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ATG13O75143 517 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 GRAP2O75791 330 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 CHKAP35790 457 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 NBL1P41271 181 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIA2P42262 883 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TBX4P57082 545 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP2R5DQ14738 602 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN20Q4JDL3 420 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 EPS8L1Q8TE68 723 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 P2RY11Q96G91 374 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 MARK1Q9P0L2 795 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.07■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 SERPINC1P01008 464 aa26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ARID5AQ03989 594 aa26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 EMC10Q5UCC4 262 aa26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D3BA6NDS4 549 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPAN3O60637 253 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TDGF1P13385 188 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 SNX16P57768 344 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 TPM4P67936 248 aa26.05■■□□□ 1.76
HTATSF1-202ENST00000425695 EFHC1Q5JVL4 640 aa26.05■■□□□ 1.76
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