RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 GRIK1P39086 918 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 GLUD2P49448 558 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 RPS6KA1Q15418 735 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TRADDQ15628 312 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 KRT35Q92764 455 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CD101Q93033 1021 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 WDR27A2RRH5 827 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SOAT2O75908 522 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ANP32DO95626 131 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 OR1D2P34982 312 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ROR1Q01973 937 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TAP1Q03518 808 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 USTQ9Y2C2 406 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SPOPO43791 374 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TCF4P15884 667 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SEC14L1Q92503 715 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SPDL1Q96EA4 605 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 BACE2Q9Y5Z0 518 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CDH23Q9H251 3354 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SNX16P57768 344 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 DDR2Q16832 855 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TNS4Q8IZW8 715 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 LINC01553A4QN01 128 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 USP17L7P0C7H9 530 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TAS2R40P59535 323 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 RAB6CQ53S08 254 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 RXFP2Q8WXD0 754 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ALG3Q92685 438 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 RAB6CQ9H0N0 254 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CCDC134Q9H6E4 229 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CCND1P24385 295 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SLC26A9Q7LBE3 791 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 HOOK3Q86VS8 718 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 KCNK3O14649 394 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TNFRSF10BO14763 440 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 URODP06132 367 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 PSMA2P25787 234 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 DUSP4Q13115 394 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 BIRC2Q13490 618 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 DCAF12L1Q5VU92 463 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 AP1ARQ63HQ0 302 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 GPR152Q8TDT2 470 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU1-201ENST00000421832 CARNS1A5YM72 827 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 PDGFRAP16234 1089 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CTNNB1P35222 781 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 DAOAP59103 153 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 LMNB2Q03252 620 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 BHLHA9Q7RTU4 235 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 FNIP1Q8TF40 1166 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CFAP57Q96MR6 1250 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ZBP1Q9H171 429 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 E7ENQ6 273 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CAPN15O75808 1086 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CSPG5O95196 566 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 BMPR1AP36894 532 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 CCNG1P51959 295 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU1-201ENST00000421832 SLC5A3P53794 718 aa25.38■■□□□ 1.65
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