RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ROR1Q01973 937 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCY1Q08828 1119 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NME3Q13232 169 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MTM1Q13496 603 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC38Q502W7 563 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC185Q8N715 623 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PLD5Q8N7P1 536 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDH19Q8TAB3 1148 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TEKT4Q8WW24 435 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NCAPGQ9BPX3 1015 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 F8W810 466 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 M0QYT0 321 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NRP1O14786 923 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPN9O14815 690 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MDM4O15151 490 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BANF1O75531 89 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 INHAP05111 366 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM163BP0C2L3 166 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L7P0C7H9 530 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2F1P24903 491 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PCSK1P29120 753 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 L1CAMP32004 1257 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA2D1P54289 1103 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BASP1P80723 227 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GAD2Q05329 585 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MORF4L2Q15014 288 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NOMO1Q15155 1222 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM35AQ86V20 835 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 METTL23Q86XA0 190 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PQLC3Q8N755 202 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 MDM1Q8TC05 714 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TLCD1Q96CP7 247 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SMOQ99835 787 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TBK1Q9UHD2 729 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH9Q9ULB4 789 aa4.14□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 A6NNZ2 444 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 E7ENQ6 273 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNN4O15554 427 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGB1P05556 798 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ODC1P11926 461 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AMPD1P23109 780 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 BDNFP23560 247 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RBL1P28749 1068 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 LSP1P33241 339 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 NOS2P35228 1153 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 RDXP35241 583 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SCNN1AP37088 669 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC24CP53992 1094 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 HTRA3P83110 453 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIK3Q13003 919 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TUSC3Q13454 348 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM26DQ5JW98 314 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 EMC10Q5UCC4 262 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD22Q5VYY1 191 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 PCGF5Q86SE9 256 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CROCCP2Q86T23 111 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.13□□□□□ -1.75
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.13□□□□□ -1.75
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