RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 AP1G2O75843 785 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 JCHAINP01591 159 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 LRMDAQ9H2I8 198 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DISP2A7MBM2 1401 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0B4J269 797 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ESRRBO95718 433 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PROCP04070 461 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RBP1P09455 135 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KAT2BQ92831 832 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CPNE1Q99829 537 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A096LPK6 155 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MAN1A2O60476 641 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CPB1P15086 417 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DPEP1P16444 411 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MGAT1P26572 445 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PALB2Q86YC2 1186 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KANSL1LA0AUZ9 987 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 HACD1B0YJ81 288 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DCXO43602 365 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 DDHD2O94830 711 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO21O94952 628 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MYL4P12829 197 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RAG1P15918 1043 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 RTP1P59025 263 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MFN1Q8IWA4 741 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TMCC1O94876 653 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP4AP20648 1035 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 BST1Q10588 318 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC27Q6P3X3 843 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ASIC4Q96FT7 647 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM247A6NEH6 219 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PDE5AO76074 875 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MYO1DO94832 1006 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN7P35236 360 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA4DQ92854 862 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.84■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 M0R2N6 131 aa16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC6A3Q01959 620 aa16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 CPB2Q96IY4 423 aa16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 KLK14Q9P0G3 267 aa16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.83■□□□□ 0.29
CTDSP2-201ENST00000398073 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 E5RJQ4 531 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT36O76013 467 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 SLURP2P0DP57 97 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 CD274Q9NZQ7 290 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 NR2E1Q9Y466 385 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 SOAT2O75908 522 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 TNFAIP8O95379 198 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 AMPD1P23109 780 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.83■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF103O00237 685 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 VTNP04004 478 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 ME2P23368 584 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX11P35716 441 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 ARCQ7LC44 396 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 MAML3Q96JK9 1138 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS3O15072 1205 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 UBDO15205 165 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 RHOBTB1O94844 696 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 CXCL9Q07325 125 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH17Q12864 832 aa16.82■□□□□ 0.28
CTDSP2-201ENST00000398073 SNAPC2Q13487 334 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms