RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 MAP3K6O95382 1288 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 KRT7P08729 469 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TCF4P15884 667 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TYMPP19971 482 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PSMA2P25787 234 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 IL1R2P27930 398 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CDKN2BP42772 138 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN9P43378 593 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ACADSBP45954 432 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ARSEP51690 589 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CLCNKBP51801 687 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SLC6A3Q01959 620 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PLCB3Q01970 1234 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 GUCY2DQ02846 1103 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TUSC3Q13454 348 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CCINQ13939 588 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CCNG2Q16589 344 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FAM171BQ6P995 826 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 BNIPLQ7Z465 357 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 VSIG1Q86XK7 387 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FUKQ8N0W3 1084 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FAM71BQ8TC56 605 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PKMYT1Q99640 499 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ERP44Q9BS26 406 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP16Q9BY84 665 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DCLK3Q9C098 648 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SNX25Q9H3E2 840 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HESX1Q9UBX0 185 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 NOD1Q9Y239 953 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM17Q9Y577 477 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ESYT3A0FGR9 886 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 KBTBD13C9JR72 458 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TTI1O43156 1089 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 NBNO60934 754 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CXCL10P02778 98 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PDGFRBP09619 1106 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 RALAP11233 206 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC130P13994 396 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 NPR3P17342 541 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 GPD1P21695 349 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 IVDP26440 423 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MIPP30301 263 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 GBP1P32455 592 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FLT3P36888 993 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HTRA3P83110 453 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DR1Q01658 176 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ADCY1Q08828 1119 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 BFSP2Q13515 415 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TRADDQ15628 312 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC14Q49A88 953 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 RAB41Q5JT25 222 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.3□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms