RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 SLC25A52Q3SY17 297 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 FNIP1Q8TF40 1166 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 SLC46A2Q9BY10 475 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 POMKQ9H5K3 350 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 MARCH2Q9P0N8 246 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 XIRP2A4UGR9 3374 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 GRXCR2A6NFK2 248 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 M0QYT0 321 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 MTHFRP42898 656 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 NME3Q13232 169 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 NPAS3Q8IXF0 933 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 FAM172AQ8WUF8 416 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 HLA-CQ95604 372 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 NT5C3BQ969T7 300 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 TASP1Q9H6P5 420 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 DDIT4Q9NX09 232 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 IP6K2Q9UHH9 426 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 DNMT3LQ9UJW3 386 aa29.42■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 OLFM2O95897 454 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 CKMP06732 381 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 HDCP19113 662 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 TADA2BQ86TJ2 420 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF276Q8N554 614 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 ZSWIM3Q96MP5 696 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 SMPD4Q9NXE4 827 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 USTQ9Y2C2 406 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 HYOU1Q9Y4L1 999 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 IRAK2O43187 625 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 PROSCO94903 275 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 IGLV3-25P01717 112 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.37e-7■■■■■ 53.3
GIPC1-202ENST00000393028 SUSD6Q92537 303 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 PIGVQ9NUD9 493 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 RRN3Q9NYV6 651 aa29.4■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 SLC12A8A0AV02 714 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 GRID2IPA4D2P6 1211 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 HMBSP08397 361 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 KLHDC10Q6PID8 442 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 FGF13Q92913 245 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 SERPINB11Q96P15 392 aa29.39■■■□□ 2.3
GIPC1-202ENST00000393028 HDAC4P56524 1084 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 DEUP1Q05D60 604 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 BNIPLQ7Z465 357 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 CMTM8Q8IZV2 173 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 NIPA2Q8N8Q9 360 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 PRDM6Q9NQX0 595 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 CPQQ9Y646 472 aa29.38■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 PALMO75781 387 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 PRAMEF12O95522 483 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 IRF1P10914 325 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 TCF4P15884 667 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 RDXP35241 583 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 DAAM2Q86T65 1068 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 TTC16Q8NEE8 873 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 MYADMQ96S97 322 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 GKN1Q9NS71 199 aa29.37■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.299e-9■□□□□ 9.6
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GIPC1-202ENST00000393028 LRCH4O75427 683 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 AVPR1AP37288 418 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 C11orf63Q6NUN7 778 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 STRADAQ7RTN6 431 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 FAM131BQ86XD5 332 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 LRRC57Q8N9N7 239 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 NECTIN4Q96NY8 510 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 KCND1Q9NSA2 647 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 CCL26Q9Y258 94 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 DESP17661 470 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 PFKLP17858 780 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 SP100P23497 879 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 GBP1P32455 592 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 TBX4P57082 545 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 SLC7A9P82251 487 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 ZXDBP98169 803 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 WBP2Q969T9 261 aa29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 RNF8O76064 485 aa29.35■■■□□ 2.29
GIPC1-202ENST00000393028 ENDOD1O94919 500 aa29.35■■■□□ 2.29
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