RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 ST7Q9NRC1 585 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-202ENST00000392919 TBX18O95935 607 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 RARGP13631 454 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PDCLQ13371 301 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 FIGNQ5HY92 759 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM110Q86TL2 294 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 LONP2Q86WA8 852 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP97Q9P2B7 532 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MYO6Q9UM54 1294 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 YJEFN3A6XGL0 299 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 E7ENQ6 273 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MMEP08473 750 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CHRNB2P17787 502 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 DRD1P21728 446 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ACADSBP45954 432 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ID4P47928 161 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PXNP49023 591 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 GAB4Q2WGN9 574 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR23BQ6ZRT6 265 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF677Q86XU0 584 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF276Q8N554 614 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 EDEM3Q9BZQ6 932 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MIS12Q9H081 205 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 E5RJQ4 531 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NFATC1O95644 943 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP17A1P05093 508 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 OPRD1P41143 372 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CDR2Q01850 454 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ARID5AQ03989 594 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NR1H3Q13133 447 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 IRGQQ8WZA9 623 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 RMDN1Q96DB5 314 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CPXM1Q96SM3 734 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP58Q9BVL2 599 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP83Q9Y592 693 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 FRYLO94915 3013 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ANTXRLA6NF34 631 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC53A6NM62 1247 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CBFA2T2O43439 604 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO21O94952 628 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 RALAP11233 206 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 FMO1Q01740 532 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MDM4O15151 490 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 TPM3P06753 285 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 FERP16591 822 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 HOXA6P31267 233 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM35BQ8NCS4 154 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 WBP2Q969T9 261 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NACA2Q9H009 215 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 AP5Z1O43299 807 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ATG13O75143 517 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 TGM1P22735 817 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 DHCR24Q15392 516 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPN20Q4JDL3 420 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 C10orf120Q5SQS8 335 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 BTBD8Q5XKL5 378 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR5BQ86VZ2 330 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NOX5Q96PH1 765 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 PARD6AQ9NPB6 346 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB23Q9ULC3 237 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOFQ9NZM1 2061 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1W2PQJ5 194 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 LSM8O95777 96 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 NOMO3P69849 1222 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO43Q4G163 708 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 RHBDF2Q6PJF5 856 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 SARM1Q6SZW1 724 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 EXOC4Q96A65 974 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 AIPL1Q9NZN9 384 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 DNMT3LQ9UJW3 386 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 GMEB2Q9UKD1 530 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC8A2Q9UPR5 921 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-202ENST00000392919 ERBB2P04626 1255 aa28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms