RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 B3GNT5Q9BYG0 378 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 VTA1Q9NP79 307 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 GYG2O15488 501 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 GBE1Q04446 702 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ARMC2Q8NEN0 867 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 LRRN4Q8WUT4 740 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 NME7Q9Y5B8 376 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 FCHO1O14526 889 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 UGT1A9O60656 530 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ENTPD5O75356 428 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 NPTXRO95502 500 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SCNN1AP37088 669 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 TMPRSS15P98073 1019 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 BMPR2Q13873 1038 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SLC26A9Q7LBE3 791 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ARCQ7LC44 396 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC52Q8N7C0 313 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SLC13A1Q9BZW2 595 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 UGT1A7Q9HAW7 530 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 UGT1A10Q9HAW8 530 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 UGT1A8Q9HAW9 530 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SIRPGQ9P1W8 387 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 AP4E1Q9UPM8 1137 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 PPEF2O14830 753 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 OR6B3Q8NGW1 331 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SARNPP82979 210 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CDK18Q07002 472 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 BST1Q10588 318 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SEMA5AQ13591 1074 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MOB2Q70IA6 237 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 NUDCD3Q8IVD9 361 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 BEST2Q8NFU1 509 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MECRQ9BV79 373 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 H3BRB1 525 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CYP2C8P10632 490 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CRHR1P34998 444 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 RFWD3Q6PCD5 774 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MCUR1Q96AQ8 359 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SNX27Q96L92 541 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SNTG2Q9NY99 539 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CNTFP26441 200 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 BST2Q10589 180 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CHI3L2Q15782 390 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 GRIK4Q16099 956 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 RINLQ6ZS11 566 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CYS1Q717R9 158 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MPP5Q8N3R9 675 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 OPTNQ96CV9 577 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL16Q9H2A7 254 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 PLXNB2O15031 1838 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf71A6NGG8 1288 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 H0Y3Z8 333 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 BIRC5O15392 142 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 OCRLQ01968 901 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB6Q15916 424 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF792Q3KQV3 632 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 TIFABQ6ZNK6 161 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFAF2Q8N183 169 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CSPG4P5Q96PW8 444 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 PCMTD2Q9NV79 361 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 SBF1O95248 1867 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 A8MXQ7 604 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 BCAT1P54687 386 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 CMPK2Q5EBM0 449 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 KIRREL3Q8IZU9 778 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD13-201ENST00000392539 C7orf31Q8N865 590 aa27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms