RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384245.1

RNU6-17P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 17, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-17P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-17P-201ENST00000384245 KIF3BO15066 747 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 BMP15O95972 392 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 IGKV2-30P06310 120 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TRIM27P14373 513 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 KRTAP5-9P26371 169 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 MST1P26927 711 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PTGER1P34995 402 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 VPS41P49754 854 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 JAK3P52333 1124 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 WDR5P61964 334 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 DNASE1L3Q13609 305 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PMS2P11Q13670 270 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 LONRF1Q17RB8 773 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ARL13BQ3SXY8 428 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 FAM209BQ5JX69 171 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 KIAA0408Q6ZU52 694 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 BEND5Q7L4P6 421 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 BHLHA9Q7RTU4 235 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ZNF366Q8N895 744 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 NRACQ8N912 160 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PJA1Q8NG27 643 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GRAMD1AQ96CP6 724 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 HIC2Q96JB3 615 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SIGLEC11Q96RL6 698 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SCNM1Q9BWG6 230 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TM2D2Q9BX73 214 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 NUAK2Q9H093 628 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ARL8BQ9NVJ2 186 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 MTMR4Q9NYA4 1195 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TMOD4Q9NZQ9 345 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PI4KBQ9UBF8 816 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 FAM234BA2RU67 622 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 KCNQ3O43525 872 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 CBFA2T3O75081 653 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 FGBP02675 491 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SRGAP2BP0DMP2 458 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ALADP13716 330 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PRF1P14222 555 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TNFSF4P23510 183 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GABRB3P28472 473 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TACR3P29371 465 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GNALP38405 381 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 NR4A2P43354 598 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PLCD1P51178 756 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 DGKQP52824 942 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GAB1Q13480 694 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 STIM1Q13586 685 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 KCNJ12Q14500 433 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 CNGA3Q16281 694 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 P3H1Q32P28 736 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ZNF260Q3ZCT1 412 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 MRNIPQ6NTE8 343 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GLIS1Q8NBF1 620 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 C16orf52Q8NHV5 167 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 COQ8BQ96D53 544 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SNX27Q96L92 541 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 RIPOR3Q96MK2 946 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 WDR24Q96S15 920 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 MLXIPLQ9NP71 852 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SOCS2O14508 198 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 INPPL1O15357 1258 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 TLR2O60603 784 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 PLAUP00749 431 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 CTSAP10619 480 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 IDEP14735 1019 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ST6GAL1P15907 406 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 IDUAP35475 653 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 GSTM5P46439 218 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 CPA2P48052 419 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ID2Q02363 134 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 CFHR1Q03591 330 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SEMA3BQ13214 749 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 MTA1Q13330 715 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 ELF2Q15723 593 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 FAM110CQ1W6H9 321 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 C10orf25Q5T742 122 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-17P-201ENST00000384245 FAM90A2PQ658T7 463 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms