RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 RALAP11233 206 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMTNL2Q2TAL5 461 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNT1Q5JUK3 1230 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTL10Q7L3V2 364 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HS6ST3Q8IZP7 471 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCSER2Q9H7U1 834 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRPSAP2O60256 369 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RDXP35241 583 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM150AQ86TG1 271 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM131BQ86XD5 332 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL21Q9HBE4 155 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KLHL11Q9NVR0 708 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RWDD2BP57060 319 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC38Q5VT99 294 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNX30Q5VWJ9 437 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMC8Q8IU68 726 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCAPGQ9BPX3 1015 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CORO1BQ9BR76 489 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC3Q9BY71 257 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 SMOC2Q9H3U7 446 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGFLR1Q9H665 355 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 DPP7Q9UHL4 492 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPDYE4A6NLX3 237 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 MDM4O15151 490 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TLR5O60602 858 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGLV3-25P01717 112 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 F11P03951 625 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHOXF2BP0C7M4 288 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 MMGT1Q8N4V1 131 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RHOXF2Q9BQY4 288 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HOXA9P31269 272 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFEMP1Q12805 493 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 C10orf120Q5SQS8 335 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 AADACL2Q6P093 401 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 POLNQ7Z5Q5 900 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRT7P08729 469 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RARAP10276 462 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 GABRR2P28476 465 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNC3Q14003 757 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC185Q8N715 623 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSPH1Q92598 858 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 F9P00740 461 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PYGMP11217 842 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 GBP1P32455 592 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP3CCP48454 512 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 GAREM2Q75VX8 874 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KATNAL2Q8IYT4 538 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 IRAK2O43187 625 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 HECTD3Q5T447 861 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASAH2Q9NR71 780 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 OBSL1O75147 1896 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 C2orf78A6NCI8 922 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 FGGP02679 453 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYL4P12829 197 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRIN2CQ14957 1233 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 MIB1Q86YT6 1006 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARD6BQ9BYG5 372 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.81■■■□□ 2.2
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