RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 P2RX5Q93086 422 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 GDF15Q99988 308 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 TBK1Q9UHD2 729 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SMCO2A6NFE2 343 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 A8MU76 341 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 VWA5AO00534 786 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PDPK1O15530 556 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ADAM11O75078 769 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 FGGP02679 453 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PRKAR1BP31321 381 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 GK3PQ14409 553 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ERAP2Q6P179 960 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 IYDQ6PHW0 289 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 LACC1Q8IV20 430 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PMEPA1Q969W9 287 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 TMEM206Q9H813 350 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RIPK3Q9Y572 518 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SFI1A8K8P3 1242 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 H3BUI4 141 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SNPHO15079 494 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 UGT2B4P06133 528 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 KRT3P12035 628 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ITGAXP20702 1163 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CD247P20963 164 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 DNAJB2P25686 324 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 HSPA1LP34931 641 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 OR3A3P47888 321 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 OCA2Q04671 838 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SNX17Q15036 470 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 MAN2A1Q16706 1144 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 HPS6Q86YV9 775 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CNBD2Q96M20 576 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 A0A087X0T9 212 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 A0A0G2JLW4 131 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 J3QRK9 145 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 FCHO1O14526 889 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CLPXO76031 633 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 GZMAP12544 262 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 TRIM23P36406 574 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 NR4A2P43354 598 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RGS7P49802 495 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 DNA2P51530 1060 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 ESRRGP62508 458 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 RHAGQ02094 409 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 KRT17Q04695 432 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CALCOCO2Q13137 446 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 HIC1Q14526 733 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 DLG2Q15700 870 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-204ENST00000354662 CCDC25Q86WR0 208 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms