RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343060.4

HOXA1-201, Transcript of homeobox A1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1-201ENST00000343060 SPATA18Q8TC71 538 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 USP6NLQ92738 828 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 FAF2Q96CS3 445 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 RTKNQ9BST9 563 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 APOL6Q9BWW8 343 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SDCBP2Q9H190 292 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 STK39Q9UEW8 545 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ATG7O95352 703 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SLC1A6P48664 564 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 LIG4P49917 911 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CNGA3Q16281 694 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 DOK7Q18PE1 504 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CYS1Q717R9 158 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 JOSD2Q8TAC2 188 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 FNDC8Q8TC99 324 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 RSAD1Q9HA92 442 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 VPS28Q9UK41 221 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.99□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 GPR25O00155 361 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PLIN3O60664 434 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 TOM1L1O75674 476 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ICAM1P05362 532 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 COX4I1P13073 169 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CCDC130P13994 396 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 GRK2P25098 689 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SOX10P56693 466 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PCLAFQ15004 111 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 KCNT1Q5JUK3 1230 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CYP4A22Q5TCH4 519 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 BIRC8Q96P09 236 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 BTBD7Q9P203 1132 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 FEM1BQ9UK73 627 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 E9PBE3 544 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ADCY3O60266 1144 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 GLRA3O75311 464 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 DGAT1O75907 488 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 HDAC4P56524 1084 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 LPIN1Q14693 890 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ACAP1Q15027 740 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 BBS5Q8N3I7 341 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SCN9AQ15858 1988 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 TMEM221A6NGB7 291 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PRKCGP05129 697 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 KRT3P12035 628 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PTGER2P43116 358 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ALDH3B2P48448 385 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 CD97P48960 835 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ACOT2P49753 483 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 GALK1P51570 392 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 STEAP4Q687X5 459 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ZNF534Q76KX8 674 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 MAP7D3Q8IWC1 876 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.97□□□□□ -0.81
HOXA1-201ENST00000343060 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms