RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CEP76Q8TAP6 659 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TATDN2Q93075 761 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TIGD1Q96MW7 591 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SLC32A1Q9H598 525 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CISHQ9NSE2 258 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.19■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PRRT4C9JH25 899 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 MDM4O15151 490 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF217O75362 1048 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 RARGP13631 454 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 NDUFV2P19404 249 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ARID3AQ99856 593 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CD248Q9HCU0 757 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.18■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PLA2G4AP47712 749 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 DGKGP49619 791 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 RAD23BP54727 409 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC63Q05C16 580 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF33AQ06730 810 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CBWD6Q4V339 395 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 Q6ZNB5 142 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 GABRG3Q99928 467 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 NAGPAQ9UK23 515 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 USP3Q9Y6I4 520 aa22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SERPINF2P08697 491 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PSEN1P49768 467 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SEMA3BQ13214 749 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SCD5Q86SK9 330 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 BHMTQ93088 406 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CAPN10Q9HC96 672 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 RAD54BQ9Y620 910 aa22.16■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CISD3P0C7P0 127 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PIP4P1Q86T03 277 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF276Q8N554 614 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 PLK2Q9NYY3 685 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.15■■□□□ 1.14
SOCS1-201ENST00000332029 GFRA2O00451 464 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 STC2O76061 302 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 RALAP11233 206 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 STIM1Q13586 685 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 HSPA12BQ96MM6 686 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.14■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 IGF2RP11717 2491 aa22.14■■□□□ 1.13
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