RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MATKP42679 507 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 NNTQ13423 1086 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ATP2A3Q93084 1043 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ZFYVE19Q96K21 471 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ISCUQ9H1K1 167 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 MYOFQ9NZM1 2061 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ARNTLO00327 626 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 HMBSP08397 361 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TC2NQ8N9U0 490 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00597Q9H2U6 94 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 IMPACTQ9P2X3 320 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM59LQ9UK28 342 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TLR6Q9Y2C9 796 aa27.92■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 GLULP15104 373 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 HARS2P49590 506 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 RING1Q06587 406 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 NR1H3Q13133 447 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 RUNX3Q13761 415 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 EML3Q32P44 896 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 SLC44A4Q53GD3 710 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 UNC45BQ8IWX7 931 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 C3orf20Q8ND61 904 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM11Q96F44 468 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 SELENOOQ9BVL4 669 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 DEF6Q9H4E7 631 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 STAP1Q9ULZ2 295 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 WNT6Q9Y6F9 365 aa27.91■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TRIOO75962 3097 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 SIGLEC16A6NMB1 481 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 GREM1O60565 184 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 KRT3P12035 628 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TBX4P57082 545 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM67Q6ZTA4 783 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 ASIC4Q96FT7 647 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC42Q96M95 316 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 EBF3Q9H4W6 596 aa27.9■■■□□ 2.06
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087X0T9 212 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 NFATC1O95644 943 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 FAM228BP0C875 321 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 MYBL1P10243 752 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 NUGGCQ68CJ6 796 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM68Q6AZZ1 485 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 Q6ZNB5 142 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 TAC4Q86UU9 113 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 CPA6Q8N4T0 437 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 WBP2Q969T9 261 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 SHDQ96IW2 340 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 PANX2Q96RD6 677 aa27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 TECTAO75443 2155 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 MSI1O43347 362 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 AKR1B10O60218 316 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 F9P00740 461 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 IGLV3-25P01717 112 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 IGLV3-27P01718 113 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 AMPD2Q01433 879 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 PRKCQQ04759 706 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 TNK2Q07912 1038 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 SLC18A3Q16572 532 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 SLC25A52Q3SY17 297 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC24Q6P3W2 148 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 BBS7Q8IWZ6 715 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM32Q8TC27 787 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 NT5C3BQ969T7 300 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 CHP1Q99653 195 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 ECT2Q9H8V3 914 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 HPS4Q9NQG7 708 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 PARVAQ9NVD7 372 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 GTSE1Q9NYZ3 720 aa27.88■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD62A6NC57 917 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 DLL1O00548 723 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 KLKB1P03952 638 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 SLC2A3P11169 496 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 ARSAP15289 507 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 RRM1P23921 792 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC122Q5T0U0 273 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 DENND1CQ8IV53 801 aa27.87■■■□□ 2.05
CRIP1-201ENST00000330233 AZIN2Q96A70 460 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms