RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 FIBCD1Q8N539 461 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 ZNF653Q96CK0 615 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 RAD9AQ99638 391 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 RTP3Q9BQQ7 232 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 DUSP16Q9BY84 665 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 THAP2Q9H0W7 228 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CYLDQ9NQC7 956 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SPG21Q9NZD8 308 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 HCRTO43612 131 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 NUDT17P0C025 328 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TPBGLP0DKB5 382 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CCDC130P13994 396 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 ADORA2BP29275 332 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 POLE2P56282 527 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 USP41Q3LFD5 358 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 ZNF280DQ6N043 979 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 UBA3Q8TBC4 463 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SLC35G2Q8TBE7 412 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SLC2A14Q8TDB8 520 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 FBF1Q8TES7 1133 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 FAM136AQ96C01 138 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MED10Q9BTT4 135 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TTPALQ9BTX7 342 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 GPR62Q9BZJ7 368 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 HCSTQ9UBK5 93 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SCINQ9Y6U3 715 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 COL4A6Q14031 1691 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TSC2P49815 1807 aa10.6□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 KCNK3O14649 394 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PEX11AO75192 247 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MTA2O94776 668 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SUN1O94901 812 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 GJB6O95452 261 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 EFEMP2O95967 443 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 ACADSBP45954 432 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 GABRB2P47870 512 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SMARCB1Q12824 385 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 RASIP1Q5U651 963 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 FOXB2Q5VYV0 432 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 C4orf50Q6ZRC1 276 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 ANKS3Q6ZW76 656 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TTC30AQ86WT1 665 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 FITM2Q8N6M3 262 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PHC3Q8NDX5 983 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 C18orf8Q96DM3 657 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TMEM169Q96HH4 297 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SYNCQ9H7C4 482 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 RXFP1Q9HBX9 757 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PARVAQ9NVD7 372 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 MYBPHLA2RUH7 354 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 FAM200BP0CF97 657 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 LMNB2Q03252 620 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 TAP1Q03518 808 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PTP4A2Q12974 167 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 RPS6KA1Q15418 735 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 DNAAF5Q86Y56 855 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SYCE1Q8N0S2 351 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 ARHGEF26Q96DR7 871 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SMARCD1Q96GM5 515 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 HSFY1Q96LI6 401 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 PKMYT1Q99640 499 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 AP1M1Q9BXS5 423 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
GINS3-201ENST00000318129 VCXQ9H320 206 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms