RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TSC2P49815 1807 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ANO9A1A5B4 782 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CTAGE9A4FU28 777 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PJA2O43164 708 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TGFB1I1O43294 461 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PHACTR2O75167 634 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SERPING1P05155 500 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PSMC3P17980 439 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TMOD1P28289 359 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 HOXD13P35453 343 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FAM193AP78312 1265 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KIF5AQ12840 1032 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MAPK7Q13164 816 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 USP41Q3LFD5 358 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 XKR3Q5GH77 459 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PDXDC1Q6P996 788 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 VITQ6UXI7 678 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GBP6Q6ZN66 633 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 USP37Q86T82 979 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GPR65Q8IYL9 337 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ANKRD7Q92527 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PGBD4Q96DM1 585 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MSANTD3Q96H12 275 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FAM81BQ96LP2 452 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CHP1Q99653 195 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 RSAD1Q9HA92 442 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF302Q9NR11 478 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CDC23Q9UJX2 597 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SAMM50Q9Y512 469 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 A0A087WV48 116 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 A6NHS1 94 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ARNTLO00327 626 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF263O14978 683 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 DCLK1O15075 740 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MAGEB2O15479 319 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PAX4O43316 350 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ATP8B1O43520 1251 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CHMP2AO43633 222 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF862O60290 1169 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 HIP1RO75146 1068 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CCNE2O96020 404 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NTRK1P04629 796 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 GTF2H1P32780 548 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PRKCIP41743 596 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ARHGAP25P42331 645 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SOX9P48436 509 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 CASP5P51878 434 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 VAV2P52735 878 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NCKAP1LP55160 1127 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 IRX4P78413 519 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SEMA3BQ13214 749 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 FUT10Q6P4F1 479 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CLDN10-201ENST00000299339 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms