RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289175.10

LRRFIP1-202, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRFIP1, Length 3,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1-202ENST00000289175 ACBD6Q9BR61 282 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ASAH2Q9NR71 780 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CHST7Q9NS84 486 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 H0Y626 953 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MAPK13O15264 365 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 KCNN4O15554 427 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PAEPP09466 180 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 TUBP50607 506 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 TBX4P57082 545 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 RASIP1Q5U651 963 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 P3H4Q92791 437 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 LGMNQ99538 433 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CPQQ9Y646 472 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CACNA1EQ15878 2313 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 TEAD2Q15562 447 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PID1Q7Z2X4 250 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PIGVQ9NUD9 493 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SCN5AQ14524 2016 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 KIAA0355O15063 1070 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SEPT6Q14141 434 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 NAT14Q8WUY8 206 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 IQCDQ96DY2 449 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 BCO2Q9BYV7 579 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZNF576Q9H609 170 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PMPCBO75439 489 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM81BQ96LP2 452 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 RUFY1Q96T51 708 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 NFU1Q9UMS0 254 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SOD2P04179 222 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 UNC93AQ86WB7 457 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 RBP3P10745 1247 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 LRPAP1P30533 357 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 BBS9Q3SYG4 887 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SNX12Q9UMY4 172 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 A0A0U1RQS6 177 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM72CH0Y354 149 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SCAMP1O15126 338 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 LRCH4O75427 683 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PPM1AP35813 382 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 PRKCIP41743 596 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 LRRC31Q6UY01 552 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 MON1BQ7L1V2 547 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM72BQ86X60 149 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 YAF2Q8IY57 180 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 ACTL9Q8TC94 416 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRFIP1-202ENST00000289175 TRIM11Q96F44 468 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms