RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF185O15231 689 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LTFP02788 710 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 AMHR2Q16671 573 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 IMPG1Q17R60 797 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MOB2Q70IA6 237 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZIM3Q96PE6 472 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RNF157Q96PX1 679 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GMNCA6NCL1 334 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 C9IYK1 514 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PIRO00625 290 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJC6O75061 913 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 BLVRAP53004 296 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RAD23BP54727 409 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF398Q8TD17 642 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SP110Q9HB58 689 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 B3GAT3O94766 335 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MIPP30301 263 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ASPAP45381 313 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TPI1P60174 286 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GPS1Q13098 491 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NOMO1Q15155 1222 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 AP1G2O75843 785 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 VTNP04004 478 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TPSB2P20231 275 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RFC2P35250 354 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SOX10P56693 466 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TPSAB1Q15661 275 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 E5RI56 91 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LIASO43766 372 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF286BP0CG31 522 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CYBAP13498 195 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GRIK1P39086 918 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 STKLD1Q8NE28 680 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TCHHQ07283 1943 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ESYT3A0FGR9 886 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 THPOP40225 353 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PPP3CCP48454 512 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ABHD8Q96I13 439 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PRRG1O14668 218 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MAP3K13O43283 966 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 B4GALT5O43286 388 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ANP32DO95626 131 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MAPK8P45983 427 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ITGA8P53708 1063 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GEMP55040 296 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 IRX4P78413 519 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PLD1Q13393 1074 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MOGSQ13724 837 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PIGZQ86VD9 579 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ALLCQ8N6M5 410 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 IPPQ9Y573 584 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM66O15016 1216 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LRCH4O75427 683 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TADA2AO75478 443 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ACOT1Q86TX2 421 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms