RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 CES5AQ6NT32 575 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 RNF139Q8WU17 664 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA1Q92805 767 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 PEBP4Q96S96 227 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZWILCHQ9H900 591 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CPQQ9Y646 472 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MYO1FO00160 1098 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 LRCH4O75427 683 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FBXO21O94952 628 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GPD1P21695 349 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 HOXA9P31269 272 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SDC4P31431 198 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 HECTD3Q5T447 861 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CCDC185Q8N715 623 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 NETO2Q8NC67 525 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MYADMQ96S97 322 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SPEGQ15772 3267 aa11.32□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SLC12A8A0AV02 714 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 IL9P15248 144 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FSHRP23945 695 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 AVPR1AP37288 418 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TAS2R40P59535 323 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 AADACL2Q6P093 401 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 HLA-CQ95604 372 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SLC2A13Q96QE2 648 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ASB3Q9Y575 518 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CLUHO75153 1309 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 KRT86O43790 486 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 KLKB1P03952 638 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MYBL1P10243 752 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 COMTP21964 271 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 KRT35Q92764 455 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FGF14Q92915 247 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 RNF34Q969K3 372 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 P2RY11Q96G91 374 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 WDR24Q96S15 920 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 NPY6RQ99463 290 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SIK2Q9H0K1 926 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CYLDQ9NQC7 956 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 DPP7Q9UHL4 492 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SCINQ9Y6U3 715 aa11.31□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 DAB1O75553 588 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 MIPP30301 263 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CXCR5P32302 372 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 NOS2P35228 1153 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 EPHA5P54756 1037 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 DEUP1Q05D60 604 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CA9Q16790 459 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 SLC25A52Q3SY17 297 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 FAM78AQ5JUQ0 283 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TRIM68Q6AZZ1 485 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TTC8Q8TAM2 541 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 TRIM11Q96F44 468 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 GCNAQ96QF7 691 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TTPA-201ENST00000260116 CD207Q9UJ71 328 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms