RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 IGLV3-25P01717 112 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 CETN2P41208 172 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 COPS2P61201 443 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 GPM6BQ13491 265 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 VEPH1Q14D04 833 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 CALN1Q9BXU9 219 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.52■□□□□ 0.56
IMP4-201ENST00000259239 IRAK2O43187 625 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 LPXNO60711 386 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 GLUD1P00367 558 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 RARGP13631 454 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PTPN7P35236 360 aa18.52■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 ARSEP51690 589 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 TERF1P54274 439 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 EPHB3P54753 998 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 ADCY2Q08462 1091 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PLD1Q13393 1074 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 DPYSL3Q14195 570 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 KRT81Q14533 505 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 TAF12Q16514 161 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PPP2R5EQ16537 467 aa18.52■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 TSC1Q92574 1164 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 UBXN4Q92575 508 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 FZD10Q9ULW2 581 aa18.52■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 H3BNC9 293 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 F9P00740 461 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MMRN1Q13201 1228 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PPP2R2DQ66LE6 453 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MMGT1Q8N4V1 131 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 KRT12Q99456 494 aa18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PCDH18Q9HCL0 1135 aa18.51■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 MSRAQ9UJ68 235 aa18.51■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 GBP1P32455 592 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 CXCR3P49682 368 aa18.5■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 PDK2Q15119 407 aa18.5■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 RAB30Q15771 203 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 DPYSL2Q16555 572 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 TAZQ16635 292 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PRELID2Q8N945 189 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 PSMG2Q969U7 264 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MYRFLQ96LU7 910 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 EPC1Q9H2F5 836 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.5■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 I6L893 689 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 TBX18O95935 607 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 RHOXF2BP0C7M4 288 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 EFEMP1Q12805 493 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 OVCA2Q8WZ82 227 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 RNF34Q969K3 372 aa18.49■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 SERPINB11Q96P15 392 aa18.49■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 ADRA1BP35368 520 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 DYNLT1P63172 113 aa18.49■□□□□ 0.55
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IMP4-201ENST00000259239 RFX6Q8HWS3 928 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 FAM71BQ8TC56 605 aa18.49■□□□□ 0.55
IMP4-201ENST00000259239 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.49■□□□□ 0.55
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