RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 PQLC3Q8N755 202 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 PLD5Q8N7P1 536 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 HASPINQ8TF76 798 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 C8orf48Q96LL4 319 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 RUFY1Q96T51 708 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNK16Q96T55 309 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 TBX21Q9UL17 535 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 NFS1Q9Y697 457 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFRSF10BO14763 440 aa9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 XRCC4Q13426 336 aa9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 CA9Q16790 459 aa9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 TCTN1Q2MV58 587 aa9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM60Q495X7 471 aa9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.91□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 H3BRJ5 948 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 H7C4K7 107 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 M0QYT0 321 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPN9O14815 690 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 TBC1D4O60343 1298 aa9.9□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 GALTP07902 379 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 USP17L7P0C7H9 530 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 RBP3P10745 1247 aa9.9□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2F1P24903 491 aa9.9□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 HCAR3P49019 387 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC11A1P49279 550 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 DYNLT1P63172 113 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ROR1Q01973 937 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 DEUP1Q05D60 604 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 EMC10Q5UCC4 262 aa9.9□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF280DQ6N043 979 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 FUT10Q6P4F1 479 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 HOOK3Q86VS8 718 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC43Q8N309 656 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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