RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 GGA3Q9NZ52 723 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 RLFQ13129 1914 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 H3BNX3 289 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PROCP04070 461 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CDK4P11802 303 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ALDH1A3P47895 512 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 LZTS1Q9Y250 596 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CAPN8A6NHC0 703 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 MCF2LO15068 1137 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ATP6V1G1O75348 118 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 TNFAIP8O95379 198 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 KRT7P08729 469 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CBLBQ13191 982 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 KCNJ11Q14654 390 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 TAZQ16635 292 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 KBTBD6Q86V97 674 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 AHI1Q8N157 1196 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ACAD9Q9H845 621 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 RAB26Q9ULW5 256 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PARP14Q460N5 1801 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 EXTL3O43909 919 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 KRT38O76015 456 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 VNN1O95497 513 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CRHR1P34998 444 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 BORAQ6PGQ7 559 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 LRRC43Q8N309 656 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 GAB3Q8WWW8 586 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 APOL6Q9BWW8 343 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 THEGQ9P2T0 379 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CHADO15335 359 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 MAFGO15525 162 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 HIPK4Q8NE63 616 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 RDM1Q8NG50 284 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DNAJA2O60884 412 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 SIN3BO75182 1162 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DGAT1O75907 488 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 APOC2P02655 101 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PRKCHP24723 683 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ACOT2P49753 483 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 SERPINB8P50452 374 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 KRT81Q14533 505 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DDI1Q8WTU0 396 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXA11-201ENST00000006015 DOCK1Q14185 1865 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 FAM189A1O60320 539 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 MYL4P12829 197 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 ITGAXP20702 1163 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 KDELR1P24390 212 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF132P52740 706 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA11-201ENST00000006015 BMPR2Q13873 1038 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms