RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc182Q9D9C6 152 aa10.6□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnni1Q9WUZ5 187 aa10.6□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm29554A0A087WNW4 188 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ildr2B5TVM2 661 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp839E9PUU5 921 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfrsf11bO08712 401 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ChkaO54804 453 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 E2f6O54917 272 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rdh7O88451 316 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pias1O88907 651 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Schip1P0DPB4 484 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ephb2P54763 986 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfm3P63056 478 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankmy2Q3TPE9 440 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Drc1Q3USS3 753 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpp2Q64514 1262 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf512Q69Z99 562 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CgasQ8C6L5 507 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akr1c14Q91WT7 323 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cox16Q9CR63 106 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmco5aQ9D9D5 303 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map3k14Q9WUL6 942 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C7D3YXF5 845 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc7bE9Q6P5 843 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SPINDOCQ05AH6 381 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tanc1Q0VGY8 1856 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aarsd1Q3THG9 412 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nlgn2Q69ZK9 836 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GnasQ6R0H7 1133 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1046Q7TR79 316 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Armc12Q80X86 340 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Colgalt1Q8K297 617 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Unc93b1Q8VCW4 598 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rem2Q8VEL9 341 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pth2rQ91V95 546 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rilpl2Q99LE1 197 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tssk3Q9D2E1 268 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adrm1Q9JKV1 407 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AuhQ9JLZ3 314 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ripk3Q9QZL0 486 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Net1Q9Z206 595 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa10.59□□□□□ -0.71
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13276A0A087WR18 182 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atf6F6VAN0 656 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Art2bO35975 289 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd86P42082 309 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SiaeP70665 541 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GaaP70699 953 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb48Q1H9T6 681 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q32P12 615 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc110Q3V125 848 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rxfp1Q6R6I7 758 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr212Q7TS33 327 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgap11aQ80Y19 987 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pramel7Q810Y8 479 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf76Q8BMU0 568 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zmiz2Q8CIE2 920 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NcaldQ91X97 193 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrp8Q924X6 996 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PdiltQ9DAN1 588 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LactbQ9EP89 551 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rsc1a1Q9ER99 582 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mpp5Q9JLB2 675 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acox2Q9QXD1 681 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Copg2Q9QXK3 871 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mapk13Q9Z1B7 366 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf19bA2A7Q9 732 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ces1bD3Z5G7 567 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm4788E9Q8B5 879 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp358E9Q8M1 571 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cacna2d1O08532 1103 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdss1Q33DR2 409 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plcl1Q3USB7 1096 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sp140Q6NSQ5 534 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300aQ6SJQ0 318 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1057Q7TR75 315 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ItpkcQ7TS72 678 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd45Q810N6 248 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf784Q8BI69 297 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lig4Q8BTF7 911 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dpp9Q8BVG4 862 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zbtb6Q8K088 423 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lims2Q91XD2 341 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lpin1Q91ZP3 924 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PmpcbQ9CXT8 489 aa10.58□□□□□ -0.72
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Terb2Q9D494 218 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms