RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PLLPQ9Y342 182 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SNX24Q9Y343 169 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM120BA0PK00 339 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KLK8O60259 260 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 GREM1O60565 184 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ETS1P14921 441 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MAGEA4P43358 317 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PDE6CP51160 858 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 UBXN2AP68543 259 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FAM189BP81408 668 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NR6A1Q15406 480 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 XKR5Q6UX68 686 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 LSMEM2Q8N112 164 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 LMLNQ96KR4 655 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KRT82Q9NSB4 513 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF639Q9UID6 485 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 F8W8V4 182 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 DLGAP1O14490 977 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SLC22A2O15244 555 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MMP3P08254 477 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TNFAIP3P21580 790 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FGFR4P22455 802 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PRDX6P30041 224 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 GUCY2FP51841 1108 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 STXBP2Q15833 593 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 INSCQ1MX18 579 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 RANBP9Q96S59 729 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 LACTBL1A8MY62 500 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ZWINTO95229 277 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 VDRP11473 427 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KCNJ1P48048 391 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KCNJ2P63252 427 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CA9Q16790 459 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 JADE1Q6IE81 842 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NIM1KQ8IY84 436 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TTC17Q96AE7 1141 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PDFQ9HBH1 243 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FNIP2Q9P278 1114 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 A0A088AWK7 358 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PDLIM1O00151 329 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NDC80O14777 642 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CRABP2P29373 138 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 GNA15P30679 374 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PLCB3Q01970 1234 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NEDD9Q14511 834 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PCLAFQ15004 111 aa7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PDK2Q15119 407 aa7.03□□□□□ -1.28
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