RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 BBS2Q9BXC9 721 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 MARK1Q9P0L2 795 aa21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRT13P13646 458 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 NTSR1P30989 418 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACOX2Q99424 681 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1W2PQF6 199 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRRT4C9JH25 899 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIF11P52732 1056 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 Q6ZNB5 142 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYT12Q8IV01 421 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAGPAQ9UK23 515 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ASPMQ8IZT6 3477 aa21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.88■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 ENPEPQ07075 957 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADAM9Q13443 819 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF394Q53GI3 561 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCD5Q86SK9 330 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHPFQ8IZ52 775 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 BHMTQ93088 406 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 DUSP16Q9BY84 665 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD248Q9HCU0 757 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITPKAP23677 461 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLA2G4AP47712 749 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 DEFB119Q8N690 84 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEMA4DQ92854 862 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 P2RY11Q96G91 374 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLK2Q9NYY3 685 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP3Q9Y6I4 520 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 AP5Z1O43299 807 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 STC2O76061 302 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CISD3P0C7P0 127 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ENGP17813 658 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 NDUFV2P19404 249 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAPK8P45983 427 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 DGKGP49619 791 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 PSEN1P49768 467 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRT39Q6A163 491 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 GABRG3Q99928 467 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAD54BQ9Y620 910 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1W2PQ64 194 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1W2PQD8 194 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CEACAM1P13688 526 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 GTF2H1P32780 548 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 DPP6P42658 865 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SDE2Q6IQ49 451 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF276Q8N554 614 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC3-208ENST00000616074 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.84■■□□□ 1.09
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