RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RASA4	O43374	803 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM155B	O75949	473 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CD4	P01730	458 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ERBB2	P04626	1255 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GRIK1	P39086	918 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SCTR	P47872	440 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GDF10	P55107	478 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC8A3	P57103	927 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CAP1	Q01518	475 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MCU	Q8NE86	351 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	P3H4	Q92791	437 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	LGMN	Q99538	433 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232		M0QYT0	321 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBED1	O96006	694 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SEPT6	Q14141	434 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CA9	Q16790	459 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	WNT8B	Q93098	351 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC188	H7C350	402 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CILP	O75339	1184 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CAPN15	O75808	1086 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MMP8	P22894	467 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	IL1R2	P27930	398 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ADAM17	P78536	824 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB16	Q05516	673 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TCEA2	Q15560	299 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DDR2	Q16832	855 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	RUBCN	Q92622	972 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NCOR1	O75376	2440 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DNM1L	O00429	736 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CCL22	O00626	93 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR182	O15218	404 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PIRT	P0C851	137 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	VDR	P11473	427 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	WEE1	P30291	646 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GRIA1	P42261	906 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	APLP1	P51693	650 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	CLCNKB	P51801	687 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF132	P52740	706 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NUP205	Q92621	2012 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF560	Q96MR9	790 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SPON2	Q9BUD6	331 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	NOD2	Q9HC29	1040 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78	2e-10	■■■■□ 19.9
CTCFL-222	ENST00000609232	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	KPNA7	A9QM74	516 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PROSC	O94903	275 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TBX18	O95935	607 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	BRAF	P15056	766 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF6	P49848	677 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TMPRSS15	P98073	1019 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SEMG2	Q02383	582 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	ACCSL	Q4AC99	568 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	PID1	Q7Z2X4	250 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM74	Q86UV6	250 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM73	Q86UV7	250 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	WHAMM	Q8TF30	809 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	GIPC2	Q8TF65	315 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SGF29	Q96ES7	293 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CTCFL-222	ENST00000609232	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78

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