RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.126e-6■■■■■ 48.1
VIM-AS1-202ENST00000605833 COMMD8Q9NX08 183 aa22.03■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 OSER1Q9NX31 292 aa22.03■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa22.03■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 MDM4O15151 490 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 CACNG3O60359 315 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 YEATS4O95619 227 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 SERPINF2P08697 491 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 KRT85P78386 507 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEP76Q8TAP6 659 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.02■■□□□ 1.12
VIM-AS1-202ENST00000605833 OPHN1O60890 802 aa22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 HTR3DQ70Z44 454 aa22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 BAHCC1Q9P281 2608 aa22.01■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 FREM2Q5SZK8 3169 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATRXP46100 2492 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 UPK3BL1B0FP48 263 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM200BP0CF97 657 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 AP3M2P53677 418 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLDN10P78369 228 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 P2RY11Q96G91 374 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 TWNKQ96RR1 684 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 GABRG3Q99928 467 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 NMUR1Q9HB89 426 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYLDQ9NQC7 956 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLK2Q9NYY3 685 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 MARK1Q9P0L2 795 aa22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1W2PQH9 124 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 WASH3PC4AMC7 463 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARHGAP33O14559 1287 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF217O75362 1048 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 P4HA1P13674 534 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ASPAP45381 313 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 DGKGP49619 791 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 SDE2Q6IQ49 451 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.99■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 HHLA1C9JL84 531 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CD59P13987 128 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 PIK3CAP42336 1068 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 STK4Q13043 487 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZACNQ401N2 412 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 DMAC2Q9NW81 257 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 SCML2Q9UQR0 700 aa21.98■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 KLRC4O43908 158 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 NDUFS2O75306 463 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 CISD3P0C7P0 127 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 RARGP13631 454 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAOBP27338 520 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 ME1P48163 572 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLEKHG6Q3KR16 790 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 RESP18Q5W5W9 173 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 UNC93AQ86WB7 457 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.97■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1W2PQD8 194 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 HLA-DRAP01903 254 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 NR3C1P04150 777 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 Q6ZNB5 142 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 SV2AQ7L0J3 742 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.96■■□□□ 1.11
VIM-AS1-202ENST00000605833 EXOC1Q9NV70 894 aa21.96■■□□□ 1.11
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