RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591856.1

EFTUD2-221, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-221ENST00000591856 PARM1Q6UWI2 310 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 VITQ6UXI7 678 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 Q6ZNB5 142 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 RIN3Q8TB24 985 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 GOLGA1Q92805 767 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SERPINB11Q96P15 392 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 RNF38Q9H0F5 515 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SYNCQ9H7C4 482 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 KCNK12Q9HB15 430 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 RRN3Q9NYV6 651 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CCL26Q9Y258 94 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CPQQ9Y646 472 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 E2F8A0AVK6 867 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 PIK3R2O00459 728 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 DPYSL4O14531 572 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 IRAK2O43187 625 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 LATS1O95835 1130 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 VCANP13611 3396 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 PSMC3P17980 439 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TNFAIP3P21580 790 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 NOS2P35228 1153 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 MATKP42679 507 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 PTPN9P43378 593 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TAF5Q15542 800 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TRNP1Q6NT89 227 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TAC4Q86UU9 113 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 GJD3Q8N144 294 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 DNASE1L2Q92874 299 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 PLD4Q96BZ4 506 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 OTUB2Q96DC9 234 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC39A13Q96H72 371 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 NPY6RQ99463 290 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CHP1Q99653 195 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CD320Q9NPF0 282 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 STOML2Q9UJZ1 356 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SCINQ9Y6U3 715 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ANKRD62A6NC57 917 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 LEFTY2O00292 366 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 GFRA2O00451 464 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ZNF263O14978 683 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CHADO15335 359 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 STC2O76061 302 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 ENDOD1O94919 500 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 TBX18O95935 607 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 CYP1A2P05177 515 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 SRFP11831 508 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 NCAM1P13591 858 aa8.49□□□□□ -1.05
EFTUD2-221ENST00000591856 RRM1P23921 792 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms