RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587140.5

AC005580.1-202, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC005580.1, Length 562 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005580.1-202ENST00000587140 PCSK1P29120 753 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 BCAT1P54687 386 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CDH8P55286 799 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 E2F1Q01094 437 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ST3GAL1Q11201 340 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 BNIP3Q12983 259 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 USP53Q70EK8 1073 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 TNFRSF25Q93038 417 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SKA1Q96BD8 255 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ZNF560Q96MR9 790 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SLC6A18Q96N87 628 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SLITRK1Q96PX8 696 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PLK2Q9NYY3 685 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 DNM3Q9UQ16 869 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PTPRJQ12913 1337 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 MYOFQ9NZM1 2061 aa10□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 F8VP50 259 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 TSPAN3O60637 253 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CDKL5O76039 1030 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 EPHX1P07099 455 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PDGFRBP09619 1106 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 OR52Z1P0C646 297 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CISD3P0C7P0 127 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PLS3P13797 630 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ITGB6P18564 788 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 MUTP22033 750 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 COPAP53621 1224 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 HECTD3Q5T447 861 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 VSTM1Q6UX27 236 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 MYLPFQ96A32 169 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 DEPDC7Q96QD5 511 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 LHX5Q9H2C1 402 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ASB7Q9H672 318 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 GDF3Q9NR23 364 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 C2CD2Q9Y426 696 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.99□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 A0A0B4J269 797 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CSO75390 466 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SFTPCP11686 197 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PRKCHP24723 683 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PSMA5P28066 241 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PNPLA4P41247 253 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 AFMP43652 599 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 LHX1P48742 406 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ZNF132P52740 706 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 DAB2P98082 770 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ZNF174Q15697 407 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 FAM171BQ6P995 826 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 XKR5Q6UX68 686 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 UCMAQ8WVF2 138 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 SYT15Q9BQS2 421 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 YKT6O15498 198 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 WNT1P04628 370 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 PLCG1P19174 1290 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ACP1P24666 158 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 LMO2P25791 158 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 YWHAQP27348 245 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 CDC25AP30304 524 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ZNF234Q14588 700 aa9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
AC005580.1-202ENST00000587140 GEN1Q17RS7 908 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms