RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579531.5

MSI2-211, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 2

Gene MSI2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-211	ENST00000579531	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531		E9PLN8	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531		F8W8V4	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531		H0YIN7	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	KIF20A	O95235	890 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	PEX11B	O96011	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CFI	P05156	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ITGAL	P20701	1170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ACVR2A	P27037	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	COPA	P53621	1224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MAPK10	P53779	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	GRM1	Q13255	1194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	STARD3	Q14849	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531		Q6ZRM9	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	LAMB1	P07942	1786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MYH8	P13535	1937 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	LEFTY2	O00292	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	MUSK	O15146	869 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	FFAR2	O15552	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	TRIAP1	O43715	76 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	PLA2G6	O60733	806 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-211	ENST00000579531	BCAR3	O75815	825 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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