RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-208ENST00000574236 BICDL2A1A5D9 508 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 ADAM23O75077 832 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 GABBR2O75899 941 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 HMBSP08397 361 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PSEN1P49768 467 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 DGKEP52429 567 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 EFEMP1Q12805 493 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 CRY1Q16526 586 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PKDCCQ504Y2 493 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TMEM270Q6UE05 265 aa24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 RALAP11233 206 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 VDRP11473 427 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TNFRSF4P43489 277 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 BCAT1P54687 386 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 KCNH2Q12809 1159 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PLK5Q496M5 336 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PM20D1Q6GTS8 502 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 ANO7Q6IWH7 933 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 RRAGAQ7L523 313 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 RASSF3Q86WH2 238 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 DEC1Q9P2X7 70 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.41■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TBC1D3BA6NDS4 549 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 EPN2O95208 641 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TYRP14679 529 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 UBE2HP62256 183 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 TERB1Q8NA31 727 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 BHMTQ93088 406 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 BBS2Q9BXC9 721 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PLK2Q9NYY3 685 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 MARK1Q9P0L2 795 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.4■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa24.39■■□□□ 1.5
PHF23-208ENST00000574236 CACNG3O60359 315 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 GDF9O60383 454 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 LRP3O75074 770 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 ZBED1O96006 694 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 LMNB2Q03252 620 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 ADIGQ0VDE8 80 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 CSRP2Q16527 193 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 HESX1Q9UBX0 185 aa24.39■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 P4HA2O15460 535 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 CISD3P0C7P0 127 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 BCKDHBP21953 392 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 RGS7P49802 495 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 ERMP1Q7Z2K6 904 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 TADA2BQ86TJ2 420 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.38■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 SLC12A8A0AV02 714 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 PRRT4C9JH25 899 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 E7ENQ6 273 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 PIK3R2O00459 728 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 PAEPP09466 180 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 WASP42768 502 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 ZNF132P52740 706 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 SLC8A3P57103 927 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa24.37■■□□□ 1.49
PHF23-208ENST00000574236 PMF1Q6P1K2 205 aa24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms