RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMOC2Q9H3U7 446 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH2Q9P0N8 246 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRIP2Q9ULQ0 834 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF10AO00220 468 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHADO15335 359 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSF2BPO75031 334 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GDI1P31150 447 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADKP55263 362 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPC5P78333 572 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA8FQ08AF8 430 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSANTD2Q6P1R3 559 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS36Q86VN1 386 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf70Q9BRQ4 267 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRD9Q9H8M2 597 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GKN1Q9NS71 199 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPN9O14815 690 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF263O14978 683 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALADP13716 330 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF5Q15542 800 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF7Q92985 503 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM22Q9P0K1 906 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP97Q9P2B7 532 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.132e-12■■■□□ 15.7
CTDNEP1-209ENST00000574205 GZMAP12544 262 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 COG7P83436 770 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAD10Q6JQN1 1059 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR59Q6PJI9 974 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CALB1P05937 261 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZXDAP98168 799 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTP4A2Q12974 167 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 MON1BQ7L1V2 547 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR35Q9P2L0 1181 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIOO75962 3097 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADCY5O95622 1261 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFKPQ01813 784 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A13Q96QE2 648 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R14Q9NYV8 317 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 E2F8A0AVK6 867 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRAP2O75791 330 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC25BP30305 580 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSCP56915 257 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSCP1Q8WVF1 389 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM83CQ9BQN1 747 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPV5Q9NQA5 729 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYPL2Q5VXT5 272 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 EDAQ92838 391 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNASE1L2Q92874 299 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 VCPIP1Q96JH7 1222 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFYVE19Q96K21 471 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC12A8A0AV02 714 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARNTLO00327 626 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRF1P10914 325 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF6Q58WW2 860 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB106AQ8N104 65 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TC2NQ8N9U0 490 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASIC4Q96FT7 647 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 CUL9Q8IWT3 2517 aa34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMCO5BA8MYB1 307 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 PI4K2BG5E9Z4 385 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA8SH3BPF8 625 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAB1O75553 588 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDGFRLQ15198 375 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCOLN2Q8IZK6 566 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTN2O75298 545 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 STC2O76061 302 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR3DQ70Z44 454 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARCQ7LC44 396 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLD4Q96BZ4 506 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINB11Q96P15 392 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D14Q9P2M4 693 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT16Q9UBV4 365 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNT6Q9Y6F9 365 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNAR2P48551 515 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 NNTQ13423 1086 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 WBP2Q969T9 261 aa34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms