RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 USP3Q9Y6I4 520 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM24O15164 1050 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 GREM1O60565 184 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TYRP14679 529 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 LRMPQ12912 555 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CUL2Q13617 745 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PGBD3Q8N328 593 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TERB1Q8NA31 727 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.03■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 HMBSP08397 361 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CD19P15391 556 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 EFEMP1Q12805 493 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 IL31Q6EBC2 164 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PIGZQ86VD9 579 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 C11orf74Q86VG3 221 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 HMGB4Q8WW32 186 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 BHMTQ93088 406 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SLC35C1Q96A29 364 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 VPS45Q9NRW7 570 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.02■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.02■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ADAM23O75077 832 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 STC2O76061 302 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 BCKDHBP21953 392 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 KCNA4P22459 653 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 SGO2Q562F6 1265 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 RLN3Q8WXF3 142 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 HESX1Q9UBX0 185 aa22.01■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 CACNG3O60359 315 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R2P41236 205 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 WASP42768 502 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TKTL1P51854 596 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 PMS2CLQ68D20 193 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF276Q8N554 614 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 CEP63Q96MT8 703 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 PLK2Q9NYY3 685 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 MARK1Q9P0L2 795 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K13O43283 966 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 CAVIN2O95810 425 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 FMO5P49326 533 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 BCAT1P54687 386 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 COG7P83436 770 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 PDE4CQ08493 712 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 PPM1JQ5JR12 505 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 RAB41Q5JT25 222 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 Q6ZNB5 142 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TCEAL3Q969E4 200 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 SPACA7Q96KW9 195 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TULP2O00295 520 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 ZBED1O96006 694 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 HOXB2P14652 356 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 NTSR1P30989 418 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 DGKGP49619 791 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 SDE2Q6IQ49 451 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 UBA3Q8TBC4 463 aa21.98■■□□□ 1.11
PPP4C-211ENST00000567642 NELFBQ8WX92 580 aa21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.5 ms