RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPAG7O75391 227 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FYNP06241 537 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 THP07101 528 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIGD5Q53EQ6 642 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TOP6BLQ8N6T0 577 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZMIZ2Q8NF64 920 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAML1Q92585 1016 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM209Q96SK2 561 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMOQ99835 787 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SHOC2Q9UQ13 582 aa10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1W2PPM1 405 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOL1O14791 398 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 B4GALT3O60512 393 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 BRAFP15056 766 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTPN9P43378 593 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SULT1E1P49888 294 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 NME3Q13232 169 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 LPIN1Q14693 890 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCHCR1Q8TD31 782 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCED1BQ96HM7 432 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 RTP3Q9BQQ7 232 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEP41Q9BYV8 373 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TSPYL1Q9H0U9 437 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 YJEFN3A6XGL0 299 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 E7ENQ6 273 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA0754O94854 1291 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPR3P17342 541 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TKTL1P51854 596 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD300LGQ6UXG3 332 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CENPUQ71F23 418 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNIP3Q96KP6 325 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMLHEQ9NVH6 421 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTC3P53804 2025 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM72CH0Y354 149 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MDM4O15151 490 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TCEA3O75764 348 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 METTL18O95568 372 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 YY1P25490 414 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TFDP2Q14188 446 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDK2Q15119 407 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM72AQ5TYM5 149 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM72DQ6L9T8 149 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAX1BP1Q86VP1 789 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM72BQ86X60 149 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 STKLD1Q8NE28 680 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEKT4Q8WW24 435 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADAM2Q99965 735 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYT15Q9BQS2 421 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 ULBP1Q9BZM6 244 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIGVQ9NUD9 493 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 GGT7Q9UJ14 662 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNX10Q9Y5X0 201 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 A6NNZ2 444 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNM1LO00429 736 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDH16O75309 829 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 AP1G2O75843 785 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L7P0C7H9 530 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELK3P41970 407 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 GRIA1P42261 906 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MATKP42679 507 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNJ11Q14654 390 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 STAT4Q14765 748 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 DPYSL2Q16555 572 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 UPP1Q16831 310 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP7D3Q8IWC1 876 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBF1Q8TES7 1133 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PYROXD1Q8WU10 500 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAF2Q96CS3 445 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSFY1Q96LI6 401 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 LGMNQ99538 433 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms