RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	KLKB1	P03952	638 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RET	P07949	1114 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF4	P43489	277 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MIB1	Q86YT6	1006 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NAT16	Q8N8M0	369 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		22.85	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GABBR2	O75899	941 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SETSIP	P0DME0	302 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KDSR	Q06136	332 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CNGA2	Q16280	664 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ANO4	Q32M45	955 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EMC10	Q5UCC4	262 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SCML4	Q8N228	414 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY11	Q96G91	374 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	DEC1	Q9P2X7	70 aa		22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	22.84	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM24	O15164	1050 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AXIN1	O15169	862 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNG3	O60359	315 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	COG7	P83436	770 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ADIG	Q0VDE8	80 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EFEMP1	Q12805	493 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CRY1	Q16526	586 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ALLC	Q8N6M5	410 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MLKL	Q8NB16	471 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RMDN1	Q96DB5	314 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		22.83	■■□□□ 1.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	22.82	■■□□□ 1.24	7e-16	■■■■□ 20.5
PPP4C-205	ENST00000563200	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ID4	P47928	161 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP68	Q76N32	757 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RASSF3	Q86WH2	238 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TERB1	Q8NA31	727 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	BBS2	Q9BXC9	721 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HCN2	Q9UL51	889 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200		E7ENQ6	273 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SGK1	O00141	431 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP3	O75074	770 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM23	O75077	832 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CALCA	P01258	141 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TYR	P14679	529 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	STIL	Q15468	1287 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PMF1	Q6P1K2	205 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		22.82	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TIE1	P35590	1138 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DGKE	P52429	567 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SPEM2	Q0P670	501 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD6	Q86V97	674 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DCLK3	Q9C098	648 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO10	Q9UK96	956 aa		22.81	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DAOA	P59103	153 aa		22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LOXL4	Q96JB6	756 aa		22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	22.8	■■□□□ 1.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		22.8	■■□□□ 1.24

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