RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC12A8A0AV02 714 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 GREM1O60565 184 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC172P0C7W6 258 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCAM1P13591 858 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOX9P48436 509 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBED6P86452 979 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 XYLT1Q86Y38 959 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNAAF5Q86Y56 855 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF139Q8WU17 664 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 OSCP1Q8WVF1 389 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 C18orf8Q96DM3 657 aa18.26■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.511e-7■□□□□ 10
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSI1O43347 362 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFAIP3P21580 790 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD72P21854 359 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 GABRB2P47870 512 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PFKPQ01813 784 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC6A3Q01959 620 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHL30Q0D2K2 578 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 EML3Q32P44 896 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAM32Q8TC27 787 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 GOLGA1Q92805 767 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa18.25■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHISA7A6NL88 538 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 STC2O76061 302 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLKB1P03952 638 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRKCIP41743 596 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFNAR2P48551 515 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 RUNX3Q13761 415 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 HGSNATQ68CP4 663 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRIM72Q6ZMU5 477 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMC6Q7Z403 805 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.24■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 E2F8A0AVK6 867 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SART1O43290 800 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 MMP8P22894 467 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF75DP51815 510 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CENPCQ03188 943 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTP4A2Q12974 167 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFHC1Q5JVL4 640 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DEFB106AQ8N104 65 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNASE1L2Q92874 299 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 POPDC2Q9HBU9 364 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPV5Q9NQA5 729 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.23■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.513e-13■■■■■ 28
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAPN9O14815 690 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 GJB6O95452 261 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL4A2P08572 1712 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 NSFP46459 744 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNX16P57768 344 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 COG7P83436 770 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PDGFRLQ15198 375 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF6Q58WW2 860 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 HTR3DQ70Z44 454 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 IQCDQ96DY2 449 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHFRQ96EP1 664 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC2A13Q96QE2 648 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ECT2Q9H8V3 914 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.22■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 STK25O00506 426 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSF2BPO75031 334 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACAD10Q6JQN1 1059 aa18.21■□□□□ 0.51
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