RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.92■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 CBX8Q9HC52 389 aa21.92■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.92■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 E5RJQ4 531 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 STC2O76061 302 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 CYP11B1P15538 503 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 KRT9P35527 623 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 CCINQ13939 588 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC32Q14392 662 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 ANGPT1Q15389 498 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 GAB4Q2WGN9 574 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 RNF139Q8WU17 664 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 LHX5Q9H2C1 402 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 CHRDQ9H2X0 955 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 SLC12A8A0AV02 714 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 H0Y858 1186 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 ADH1CP00326 375 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 LTFP02788 710 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 HMBSP08397 361 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 JAM2P57087 298 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 COG7P83436 770 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 Q6ZNB5 142 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM110Q86TL2 294 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 LUZP1Q86V48 1076 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 NEK11Q8NG66 645 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA1Q92805 767 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 CPXM1Q96SM3 734 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.9■■□□□ 1.1
TMOD3-203ENST00000558455 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 ADH5P11766 374 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 GALK1P51570 392 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 MTAPQ13126 283 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 Q6ZS52 159 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 CD101Q93033 1021 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 SPAG5Q96R06 1193 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 CEP83Q9Y592 693 aa21.89■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 TEX33O43247 280 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 GFPT2O94808 682 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 KLKB1P03952 638 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 SOX5P35711 763 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 OPRD1P41143 372 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 TAF3Q5VWG9 929 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 EXOC4Q96A65 974 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.88■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 CAVIN2O95810 425 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 EGFP01133 1207 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 FYNP06241 537 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 NHLH1Q02575 133 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 GAS6Q14393 721 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 C12orf40Q86WS4 652 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM25Q86YD3 366 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 PLD4Q96BZ4 506 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 NOX5Q96PH1 765 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 IER2Q9BTL4 223 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 LAMTOR5O43504 91 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 NCAM1P13591 858 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 DRD1P21728 446 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 STAT1P42224 750 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 GAD2Q05329 585 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 ANO4Q32M45 955 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TMOD3-203ENST00000558455 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms