RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.6□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.6□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PQH9 124 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 HHLA1C9JL84 531 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 GIPC1O14908 333 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 TRIM24O15164 1050 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 CYP26A1O43174 497 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 CACNG3O60359 315 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 STX10O60499 249 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 GREM1O60565 184 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ZNF217O75362 1048 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 RHOBTB3O94955 611 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 CFIP05156 583 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 RARGP13631 454 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 HOXB2P14652 356 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 GABRG2P18507 467 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 CD58P19256 250 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 NR2F2P24468 414 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 GTF2H1P32780 548 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 HOXD12P35452 270 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 WASP42768 502 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 DGKGP49619 791 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 KIF11P52732 1056 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 SLC8A3P57103 927 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 COG7P83436 770 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ENPEPQ07075 957 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 INCA1Q0VD86 236 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 NFIL3Q16649 462 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ZNF276Q8N554 614 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 TTC39CQ8N584 583 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 DUSP16Q9BY84 665 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 SLC32A1Q9H598 525 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 OSER1Q9NX31 292 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 MARK1Q9P0L2 795 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 HPSEQ9Y251 543 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.59□□□□□ -1.03
COCH-211ENST00000557065 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 GFRA2O00451 464 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 NDUFS2O75306 463 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CILPO75339 1184 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CISD3P0C7P0 127 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 TRIM49P0CI25 452 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 TRIM49CP0CI26 452 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ENGP17813 658 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ITPKAP23677 461 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CHKAP35790 457 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 MAPK8P45983 427 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 NDUFA8P51970 172 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ZNF33AQ06730 810 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 PPP3CAQ08209 521 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ZNF394Q53GI3 561 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 KRT39Q6A163 491 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 SCD5Q86SK9 330 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 MIB1Q86YT6 1006 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 DEFB119Q8N690 84 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 TWNKQ96RR1 684 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 ACOX2Q99424 681 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 GABRG3Q99928 467 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 DCLK3Q9C098 648 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 NMUR1Q9HB89 426 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 PLK2Q9NYY3 685 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 METRNQ9UJH8 293 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 FBXO10Q9UK96 956 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.58□□□□□ -1.04
COCH-211ENST00000557065 HCN2Q9UL51 889 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms