RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876		A1L4Q6	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NPHP1	O15259	732 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	USP1	O94782	785 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	VIP	P01282	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NPPB	P16860	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CTGF	P29279	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NTSR1	P30989	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GATM	P50440	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	RENBP	P51606	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FOXO1	Q12778	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	BIRC3	Q13489	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PRKG1	Q13976	671 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DDB2	Q92466	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	EID2B	Q96D98	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	AGPS	O00116	658 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	NDUFB7	P17568	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	ENG	P17813	658 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	YY1	P25490	414 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	RBL1	P28749	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	CYP2C18	P33260	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	CCT5	P48643	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	CYP4F2	P78329	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TISP43	B9A030	160 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	FCHO1	O14526	889 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	PCDH17	O14917	1159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	NTSR2	O95665	410 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	PRKCG	P05129	697 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	POLE2	P56282	527 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TIRAP	P58753	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	POSTN	Q15063	836 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876		Q6ZWC4	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms