RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	TULP3	O75386	442 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	APBB3	O95704	486 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KLKB1	P03952	638 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CD19	P15391	556 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HOXC13	P31276	330 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CRY1	Q16526	586 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RASSF3	Q86WH2	238 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KAT5	Q92993	513 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HSFY1	Q96LI6	401 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	FBXO10	Q9UK96	956 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MDM4	O15151	490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	AXIN1	O15169	862 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	IRF1	P10914	325 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CHKA	P35790	457 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DGKE	P52429	567 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	C2orf27A	Q580R0	203 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CPXM2	Q8N436	756 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TERB1	Q8NA31	727 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STK32A	Q8WU08	396 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HINFP	Q9BQA5	517 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	EML5	Q05BV3	1969 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	GABBR2	O75899	941 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TYR	P14679	529 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	DAOA	P59103	153 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP8	P85298	464 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	FOXK2	Q01167	660 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	LMNB2	Q03252	620 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	EFEMP1	Q12805	493 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ANO4	Q32M45	955 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PMF1	Q6P1K2	205 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CEP68	Q76N32	757 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	RRAGA	Q7L523	313 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	UBA3	Q8TBC4	463 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	PLD4	Q96BZ4	506 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HHIP	Q96QV1	700 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	THAP9	Q9H5L6	903 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CS-223	ENST00000551137	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137		E7ENQ6	273 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	GFRA2	O00451	464 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	ADAM23	O75077	832 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	FBXO21	O94952	628 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	LATS1	O95835	1130 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CS-223	ENST00000551137	CISD3	P0C7P0	127 aa		12.02	□□□□□ -0.49

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