RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 ACADSBP45954 432 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 STARD6P59095 220 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PLCB2Q00722 1185 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CDR2Q01850 454 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PRKCQQ04759 706 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 RUNX3Q13761 415 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TAF5Q15542 800 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 NAA35Q5VZE5 725 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TMEM110Q86TL2 294 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 FBXL6Q8N531 539 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PJA1Q8NG27 643 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 STK32AQ8WU08 396 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CPA5Q8WXQ8 436 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 IRGQQ8WZA9 623 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PCDHB18PQ96TA0 734 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CEP83Q9Y592 693 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 SLC12A8A0AV02 714 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 KLKB1P03952 638 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 NCAM1P13591 858 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GLULP15104 373 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 AOC1P19801 751 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PON2Q15165 354 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PDGFRLQ15198 375 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GAB4Q2WGN9 574 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 OR6B2Q6IFH4 312 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 Q6ZNB5 142 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 C12orf40Q86WS4 652 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ZNF677Q86XU0 584 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CPA6Q8N4T0 437 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ZNF276Q8N554 614 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ADAM32Q8TC27 787 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 RNF139Q8WU17 664 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ATP2A3Q93084 1043 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 NOX5Q96PH1 765 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 RBSNQ9H1K0 784 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ECT2Q9H8V3 914 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 F5P12259 2224 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 VPS13AQ96RL7 3174 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 E2F8A0AVK6 867 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 NFATC1O95644 943 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GYPCP04921 128 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 FERP16591 822 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 AVPR2P30518 371 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GJA4P35212 333 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GABRB2P47870 512 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 DHCR24Q15392 516 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ASIC2Q16515 512 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 FIGNQ5HY92 759 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 HTR3DQ70Z44 454 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 TAC4Q86UU9 113 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 ERICH1Q86X53 443 aa9□□□□□ -0.97
CS-211ENST00000548041 XYLT1Q86Y38 959 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms