RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 HRO43593 1189 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 TULP3O75386 442 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CNR2P34972 360 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 GRIA2P42262 883 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 STILQ15468 1287 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PKDCCQ504Y2 493 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 GJB7Q6PEY0 223 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 Q6ZNB5 142 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF276Q8N554 614 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 BHMTQ93088 406 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 GBP4Q96PP9 640 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 BBS2Q9BXC9 721 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 DEC1Q9P2X7 70 aa14.71□□□□□ -0.05
BRMS1-209ENST00000534617 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 SLC12A8A0AV02 714 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 APBB3O95704 486 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TYRP14679 529 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TIE1P35590 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 DAOAP59103 153 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 COG7P83436 770 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 CNGA2Q16280 664 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 GBP6Q6ZN66 633 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ALLCQ8N6M5 410 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 RNF139Q8WU17 664 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 EDEM1Q92611 657 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 THAP9Q9H5L6 903 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.7□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 E7ENQ6 273 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TRIM24O15164 1050 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 AXIN1O15169 862 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 CACNG3O60359 315 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 SLC9A1P19634 815 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 MFAP3P55082 362 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 APBA1Q02410 837 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 EMC10Q5UCC4 262 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 PMF1Q6P1K2 205 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TERB1Q8NA31 727 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 GAB3Q8WWW8 586 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 DCLK3Q9C098 648 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 MARK1Q9P0L2 795 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 USP18Q9UMW8 372 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF292O60281 2723 aa14.69□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 FRYLO94915 3013 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 EML5Q05BV3 1969 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 THAP12O43422 761 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 KLKB1P03952 638 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 GNA15P30679 374 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 USP8P40818 1118 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 TNFRSF4P43489 277 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 DGKEP52429 567 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 MAN2A1Q16706 1144 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 ANO7Q6IWH7 933 aa14.68□□□□□ -0.06
BRMS1-209ENST00000534617 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms