RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PDCLQ13371 301 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC32Q14392 662 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 HTR3DQ70Z44 454 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM110Q86TL2 294 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 LUZP1Q86V48 1076 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PASD1Q8IV76 773 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 CLDN23Q96B33 292 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 SLC12A8A0AV02 714 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 E5RJQ4 531 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 EPHB6O15197 1021 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 ADH1CP00326 375 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 SOX5P35711 763 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 JAM2P57087 298 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 DHCR24Q15392 516 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 EDEM1Q92611 657 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 DCLK3Q9C098 648 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 TEX33O43247 280 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 STC2O76061 302 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 GFPT2O94808 682 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 CYP17A1P05093 508 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF677Q86XU0 584 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
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PTPRK-222ENST00000532751 WBP2Q969T9 261 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GTH6 734 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 HMBSP08397 361 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN5P54829 565 aa22.96■■□□□ 1.27
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PTPRK-222ENST00000532751 TAF3Q5VWG9 929 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS33Q8NF86 280 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 CD101Q93033 1021 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PLD4Q96BZ4 506 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 IER2Q9BTL4 223 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 SYNCQ9H7C4 482 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRK-222ENST00000532751 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CHRNB1P11230 501 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 ADH5P11766 374 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 GAD2Q05329 585 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CPXM1Q96SM3 734 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CHRDQ9H2X0 955 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQC6 194 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CAPN9O14815 690 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 GREM1O60565 184 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 NCAM1P13591 858 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 DRD1P21728 446 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 GALK1P51570 392 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 FANCCQ00597 558 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 Q6ZNB5 142 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CHFRQ96EP1 664 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 TSPY26PQ9H489 355 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC172P0C7W6 258 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 CCINQ13939 588 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 ANO4Q32M45 955 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRK-222ENST00000532751 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.93■■□□□ 1.26
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