RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.642e-29■■■■■ 310.5
ACER3-211ENST00000531461 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 USP3Q9Y6I4 520 aa25.3■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PQ27 194 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PQ64 194 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PQD8 194 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TRIM49P0CI25 452 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TRIM49CP0CI26 452 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 HOXB2P14652 356 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PTGER3P43115 390 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 SLC23A3Q6PIS1 610 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 Q6ZNB5 142 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TTC39CQ8N584 583 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 FRMD1Q8N878 549 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 DUSP16Q9BY84 665 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CD248Q9HCU0 757 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.29■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PQF6 199 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 A0A1W2PQH9 124 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TRIM24O15164 1050 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 RARGP13631 454 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CEACAM1P13688 526 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 GABRG2P18507 467 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ADAM9Q13443 819 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TRIM61Q5EBN2 209 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 LYSMD4Q5XG99 296 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 KRT39Q6A163 491 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 MIB1Q86YT6 1006 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PGBD3Q8N328 593 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 GABRG3Q99928 467 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 TMEM74BQ9NUR3 256 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PILRBQ9UKJ0 227 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.28■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 AP5Z1O43299 807 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 FBXO10Q9UK96 956 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.27■■□□□ 1.64
ACER3-211ENST00000531461 GFRA2O00451 464 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ZNF217O75362 1048 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CD58P19256 250 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 SDE2Q6IQ49 451 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 SCD5Q86SK9 330 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 NAGPAQ9UK23 515 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.26■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 PRRT4C9JH25 899 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 GIPC1O14908 333 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 STC2O76061 302 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CISD3P0C7P0 127 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 RALAP11233 206 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 DGKGP49619 791 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CHPFQ8IZ52 775 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CEP76Q8TAP6 659 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.25■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 MDM4O15151 490 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 COG7P83436 770 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ARMCX6Q7L4S7 300 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 RABEPKQ7Z6M1 372 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ACOX2Q99424 681 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 WASF3Q9UPY6 502 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.24■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 FRYQ5TBA9 3013 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ZNF202O95125 648 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 PENKP01210 267 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ITPKAP23677 461 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 CHKAP35790 457 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa25.23■■□□□ 1.63
ACER3-211ENST00000531461 DUOXA1Q1HG43 343 aa25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms