RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529172.1

PPP6R3-216, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-216	ENST00000529172	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	WDR24	Q96S15	920 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	DERA	Q9Y315	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172		A1L4Q6	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	DHH	O43323	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	BDNF	P23560	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	HTR7	P34969	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	BMPR1A	P36894	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	PBX1	P40424	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	LIFR	P42702	1097 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	SELENOP	P49908	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	SEC24C	P53992	1094 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	VAMP2	P63027	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	BFSP2	Q13515	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	FHL3	Q13643	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	HYI	Q5T013	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	HTRA1	Q92743	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PPP6R3-216	ENST00000529172	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	CD4	P01730	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	FES	P07332	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	LAG3	P18627	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	LIPA	P38571	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	CDK7	P50613	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68	8e-7	■■■■■ 29.1
PPP6R3-216	ENST00000529172	DGKQ	P52824	942 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	NXPH1	P58417	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	CHRND	Q07001	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	PDCL	Q13371	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	TBCC	Q15814	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	LPIN2	Q92539	896 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	MECR	Q9BV79	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP6R3-216	ENST00000529172	STX16	O14662	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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