RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528999.5

PUF60-213, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-213	ENST00000528999	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CIT	O14578	2027 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999		C9IYK1	514 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999		H3BRJ5	948 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	DNM1L	O00429	736 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CYB561D2	O14569	222 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SPTLC1	O15269	473 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF623	O75123	536 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	GRAP2	O75791	330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	RASSF9	O75901	435 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM63A	O94886	807 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MT-ND3	P03897	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	NPR3	P17342	541 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CA4	P22748	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PRKCH	P24723	683 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	LMO2	P25791	158 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CNTF	P26441	200 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	RBL1	P28749	1068 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ALDH3A1	P30838	453 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SSTR1	P30872	391 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ELK3	P41970	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	HIC1	Q14526	733 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	LRRC14	Q15048	493 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CDO1	Q16878	200 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	GALNTL6	Q49A17	601 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MSS51	Q4VC12	460 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CST9	Q5W186	159 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SCML4	Q8N228	414 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	NPY6R	Q99463	290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	HES2	Q9Y543	173 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	GPR182	O15218	404 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	NCAM2	O15394	837 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	KRT37	O76014	449 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	F9	P00740	461 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	IL1B	P01584	269 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	INHBA	P08476	426 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SKI	P12755	728 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ALAD	P13716	330 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	LCP1	P13796	627 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	KRT4	P19013	534 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	ADORA2B	P29275	332 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	FOXN2	P32314	431 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	MAGEA3	P43357	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	GLUD2	P49448	558 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SERPINB9	P50453	376 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	RAB27A	P51159	221 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	HUNK	P57058	714 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SCAP	Q12770	1279 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	BNIP1	Q12981	228 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PDK1	Q15118	436 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PIGZ	Q86VD9	579 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PUF60-213	ENST00000528999	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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