RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 EXD3Q8N9H8 876 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GTF3C6Q969F1 213 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TIPINQ9BVW5 301 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 CLEC4EQ9ULY5 219 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 A0A1B0GTQ1 180 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GFRA2O00451 464 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PRKCHP24723 683 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GSE1Q14687 1217 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GEN1Q17RS7 908 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 HYIQ5T013 277 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 KRT79Q5XKE5 535 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MYCT1Q8N699 235 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 EID2Q8N6I1 236 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 BIRC7Q96CA5 298 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 OTUB2Q96DC9 234 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MED8Q96G25 268 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 C8orf48Q96LL4 319 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ZNF560Q96MR9 790 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 KCNK16Q96T55 309 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 NUP58Q9BVL2 599 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 BBS2Q9BXC9 721 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 EBF2Q9HAK2 575 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 FBXO10Q9UK96 956 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PTPRJQ12913 1337 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PCSK1P29120 753 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 HNF1BP35680 557 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PNPLA4P41247 253 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 LHX1P48742 406 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ZNF131P52739 623 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GTF2BQ00403 316 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TMEM215Q68D42 235 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 SAP25Q8TEE9 199 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 SAAL1Q96ER3 474 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 LGMNQ99538 433 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 FAM213AQ9BRX8 229 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MARK1Q9P0L2 795 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 CDH9Q9ULB4 789 aa11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TSPAN3O60637 253 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MPOP05164 745 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 KRT19P08727 400 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 YWHAQP27348 245 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 OXTRP30559 389 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ACTN2P35609 894 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GRIA4P48058 902 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PPP3CCP48454 512 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 DGKGP49619 791 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 BNIP3Q12983 259 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 HECTD3Q5T447 861 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 HTR3DQ70Z44 454 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 FBXO32Q969P5 355 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 OSER1Q9NX31 292 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GOLGA8IPA6NC78 632 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 GOLGA8JA6NMD2 632 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 MDM4O15151 490 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 FSBPO95073 299 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNC-211ENST00000521017 IGHV4-34P06331 123 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms