RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519813.1

TMPRSS4-208, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMPRSS4, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-208ENST00000519813 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 IGBP1P78318 339 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ADAM17P78536 824 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PTK7Q13308 1070 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MTA1Q13330 715 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRRC14Q15048 493 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 LLGL1Q15334 1064 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 BBS9Q3SYG4 887 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 FITM2Q8N6M3 262 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 EMC1Q8N766 993 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 UBA3Q8TBC4 463 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MGARPQ8TDB4 240 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MZB1Q8WU39 189 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 STON2Q8WXE9 905 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 IRGQQ8WZA9 623 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 COPS5Q92905 334 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NTAN1Q96AB6 310 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 APOPT1Q96IL0 206 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 TWNKQ96RR1 684 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 DUSP16Q9BY84 665 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 TLE6Q9H808 572 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 FZD1Q9UP38 647 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PLLPQ9Y342 182 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 WDR90Q96KV7 1748 aa7.55□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 A0A0A0MRY4 1105 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 FAM159BA6NKW6 160 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 BTBD19C9JJ37 291 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 I3L4J1 428 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 M0QZ92 97 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 COPEO14579 308 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 GABRDO14764 452 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 DGKIO75912 1065 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NPTXRO95502 500 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ATP6V1G2O95670 118 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 VTNP04004 478 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NEFHP12036 1026 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ETS1P14921 441 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CREB1P16220 341 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CYP2F1P24903 491 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 GRK2P25098 689 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SSTR1P30872 391 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 FOXN2P32314 431 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 GCKP35557 465 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCNFP41002 786 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ETV4P43268 484 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 RAP1GAPP47736 663 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NPY2RP49146 381 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NEK3P51956 506 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 HDAC4P56524 1084 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NCALDP61601 193 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 DYNLT1P63172 113 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 NKX3-2P78367 333 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PDE4CQ08493 712 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SCAPQ12770 1279 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAP2K5Q13163 448 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCL15Q16663 113 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 STEAP4Q687X5 459 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 BNIPLQ7Z465 357 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 ACOT1Q86TX2 421 aa7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TMPRSS4-208ENST00000519813 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms