RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516299.1

RNU6-1232P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1232, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1232P, Length 86 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IGKV3-15P01624 115 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IGLV1-44P01699 117 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IGKV3-11P04433 115 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ENO1P06733 434 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 THP07101 528 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GJB1P08034 283 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CD48P09326 243 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RARBP10826 455 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MYF5P13349 255 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AKR1A1P14550 325 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 JUPP14923 745 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KCNA3P22001 575 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MMP8P22894 467 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PRPH2P23942 346 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ALDH4A1P30038 563 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GKP32189 559 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ETFBP38117 255 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 VPS41P49754 854 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RASSF2P50749 326 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DGKQP52824 942 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DLX5P56178 289 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KRTAP12-2P59991 146 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 HERV-K104P61576 105 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RACK1P63244 317 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ATP8B2P98198 1209 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDC42EP1Q00587 391 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PSG6Q00889 435 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MS4A2Q01362 244 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CCDC15Q0P6D6 951 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SREBF2Q12772 1141 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MALLQ13021 153 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CBFBQ13951 182 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RASGRF1Q13972 1273 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MFSD13AQ14CX5 517 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MLC1Q15049 377 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CALCRLQ16602 461 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 INSCQ1MX18 579 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ALG10Q5BKT4 473 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM76BQ5HYJ3 339 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ALG10BQ5I7T1 473 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC25A30Q5SVS4 291 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PDSS1Q5T2R2 415 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DCAF12L2Q5VW00 463 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LIPMQ5VYY2 423 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TAF2Q6P1X5 1199 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LRIG3Q6UXM1 1119 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 C9orf139Q6ZV77 190 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 Q7L0L9 218 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LRP11Q86VZ4 500 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PRR22Q8IZ63 422 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NAGSQ8N159 534 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PPM1KQ8N3J5 372 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DPP10Q8N608 796 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 Q8N7P7 452 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM169BQ8N8A8 192 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 Q8NA96 180 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GSTCDQ8NEC7 633 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 OR13A1Q8NGR1 328 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SECTM1Q8WVN6 248 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMED6Q8WW62 240 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MFSD3Q96ES6 412 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SCMH1Q96GD3 660 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMX3Q96JJ7 454 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CLMNQ96JQ2 1002 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ADGRG7Q96K78 797 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM167AQ96KS9 214 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LINC00167Q96N53 147 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IL17FQ96PD4 163 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms